ABSTRACT
RESUMEN Una cepa triple reasortante del virus Influenza A emergió en al año 2009 dando origen a una pandemia que alcanzó a Paraguay en junio del mismo año. Con el fin de investigar la evolución genética del virus influenza A (H1N1) pdm09 en Paraguay fueron analizadas las secuencias nucleotídicas del Gen de la Hemaglutinina de 20 cepas de Influenza A(H1N1)pdm09, aisladas en el Centro Nacional de Influenza de Paraguay entre los años 2009 y 2016, y secuenciadas en el Centro Colaborador de OPS/OMS en Atlanta USA. El análisis filogenético muestra la circulación de al menos 5 grupos genéticos bien diferenciados de Influenza A(H1N1)pdm09 en Paraguay desde el 2009. Solamente los virus aislados en el 2016 pertenecen al sub Grupo genético 6B.1 en el cual se encuentra la actual cepa vacunal A/Michigan/45/2015 recomendada para el hemisferio Sur desde el año 2017. Los virus circulantes en años anteriores pertenecen a grupos antigénicamente indistinguibles de la cepa vacunal previa A/California/7/2009. No se encontraron diferencias resaltantes en las secuencias de los virus, relacionadas a severidad clínica ni a distribución geográfica. Los resultados de este estudio reafirman la necesidad de una vigilancia virológica sistemática para orientar el establecimiento de estrategias adecuadas de prevención y control de la influenza.
ABSTRACT A triple reassortant strain of Influenza A virus emerged in 2009, leading to a pandemic that reached Paraguay by June the same year. In order to investigate the genetic evolution of influenza A (H1N1)pdm09 virus in Paraguay, we analized the nucleotide sequences of the Hemagglutinin gene of 20 Influenza A (H1N1)pdm09 strains, isolated at the Paraguayan National Influenza Centre between 2009 and 2016, and sequenced at the PAHO/WHO Collaborating Center in Atlanta, USA. Phylogenetic analysis shows the circulation of at least 5 well-differentiated genetic groups of Influenza A (H1N1) pdm09 in Paraguay since 2009. Only the viruses isolated in 2016 belong to genetic subgroup 6B.1, the same as the current vaccine strain A/Michigan/45/2015, recommended for the Southern hemisphere since 2017. The viruses circulated previous years belong to groups antigenically indistinguishable from the previous vaccine strain A/California/7/2009. No significant differences were found in sequences of the viruses, related to clinical severity or geographic distribution. The results of this study reaffirm the need for systematic virological surveillance to guide the establishment of adequate strategies for the prevention and control of influenza.
ABSTRACT
El Metapneumovirus humano (hMPV) constituye una importante causa de Infecciones Respiratorias Agudas (IRAs) en niños hospitalizados. En Paraguay, las IRAs están entre las primeras causas de hospitalización durante la infancia, siendo los virus los principales agentes causales. Sin embargo, aún persiste una alta proporción de casos sin etiología identificada. La pandemia de Influenza en el año 2009, condujo a una intensificación de la vigilancia de las infecciones respiratorias, lo cual permitió al mismo tiempo la búsqueda de otros virus como el hMPV. Nuestro objetivo fue detectar hMPV en niños hospitalizados por IRAs en Paraguay durante el año 2009. Fueron estudiadas 240 muestras respiratorias de niños < 5 años internados por IRAs en Paraguay durante el año 2009, que habían resultado negativas para otros virus respiratorios. Fue utilizado el reactivo LightMix Kit human MPV de TIBMOLBIOL, para la detección del gen N de hMPV por PCR en Tiempo Real, siguiendo el procedimiento indicado por el fabricante. De las 240 muestras estudiadas, 29 (12%) resultaron positivas para hMPV, con la mayor detección en julio y agosto; predominando en mayores de 1 año. Los principales signos y síntomas fueron tos, fiebre y dificultad respiratoria; y las complicaciones más frecuentes neumonía y bronquiolitis. Estos resultados proveen las primeras evidencias en Salud Pública, de la importancia del hMPV asociado a niños hospitalizados por IRAs en Paraguay.
Human metapneumovirus (hMPV) is a significant cause of acute respiratory infection (ARI) in hospitalized children. In Paraguay, ARI is one of the leading causes of childhood hospitalization, with viruses being the primary causal agents. However, a large number of cases of unknown etiology remain. The influenza pandemic of 2009 led to intensified vigilance concerning respiratory infections and more thorough efforts to confirm the presence of viruses such as hMPV. Our objective was to detect hMPV in children hospitalized for ARI in Paraguay during 2009. We studied respiratory samples from 240 children age < 5 years hospitalized for IRAs in Paraguay during 2009 who had tested negative for other respiratory viruses. We used the hMPV-reactive LightMix® kit from TIB MOLBIOL for the detection of the nucleoprotein (N) gene by real-time PCR according to manufacturer-specified procedures. Of the 240 samples studied, 29 (12%) were positive for hMPV, with the highest rates detected in July and August (winter) predominating in children over 1 year of age. The most common signs and symptoms were cough, fever, and respiratory distress; while the most common complications were pneumonia and bronchiolitis. These results provide the first evidence concerning the prevalence of hMPV in children hospitalized for ARI in Paraguay.
ABSTRACT
El Metapneumovirus humano (hMPV) constituye una importante causa de Infecciones Respiratorias Agudas (IRAs) en niños hospitalizados. En Paraguay, las IRAs están entre las primeras causas de hospitalización durante la infancia, siendo los virus los principales agentes causales. Sin embargo, aún persiste una alta proporción de casos sin etiología identificada. La pandemia de Influenza en el año 2009, condujo a una intensificación de la vigilancia de las infecciones respiratorias, lo cual permitió al mismo tiempo la búsqueda de otros virus como el hMPV. Nuestro objetivo fue detectar hMPV en niños hospitalizados por IRAs en Paraguay durante el año 2009. Fueron estudiadas 240 muestras respiratorias de niños <5 años internados por IRAs en Paraguay durante el año 2009, que habían resultado negativas para otros virus respiratorios. Fue utilizado el reactivo LightMix Kit human MPV de TIBMOLBIOL, para la detección del gen N de hMPV por PCR en Tiempo Real, siguiendo el procedimiento indicado por el fabricante. De las 240 muestras estudiadas, 29 (12%) resultaron positivas para hMPV, con la mayor detección en julio y agosto; predominando en mayores de 1 año. Los principales signos y síntomas fueron tos, fiebre y dificultad respiratoria; y las complicaciones más frecuentes neumonía y bronquiolitis. Estos resultados proveen las primeras evidencias en Salud Pública, de la importancia del hMPV asociado a niños hospitalizados por IRAs en Paraguay.